两部委要求，各地区要参照国务院部门涉企保证金目录清单，对本地区涉企保证金进一步清理规范，取消没有法律、行政法规依据或未经国务院批准的涉企保证金项目，建立涉企保证金目录清单，并于2017年12月底前向社会公布。
两部委明确，各地区、各部门必须严格执行目录清单，目录清单之外的涉企保证金，一律不得执行(完全市场化行为产生的保证金以及金融机构缴纳的保险、保障基金除外)。
财政部有关负责人表示，我国将加快对已取消保证金资金，以及逾期未返或超额收取的保证金资金的清退返还，2017年12月底前要全部完成。
工信部有关负责人表示，对违规向企业收取保证金、不按时返还、挪用保证金等行为，我国将严肃查处，加大曝光和问责力度。
配套管理制度方面，两部委要求，设有涉企保证金的地区和部门要抓紧制定完善管理制度，建立资金台账，规范管理程序，加强监督检查，严肃财经纪律，将保证金收取及返还情况向社会公开。
同时，要创新管理方式，加强事中事后监管，加快推动企业诚信体系建设，对诚信记录好的企业免收保证金或降低缴纳比例(额度)，适度扩大银行保函应用范围，减少企业资金占用。
专家表示，建立涉企保证金目录清单制度，将给企业一本明明白白的“账目”，这将从源头上降低企业制度性交易成本，给企业带来实惠，为市场增添活力。